隊(duì)列研究國際交流在寧開啟 全球?qū)W者共話中國發(fā)展路徑
9月16日,由中國 “雙一流”建設(shè)高校南京醫(yī)科大學(xué)、全球基因測序和芯片技術(shù)的領(lǐng)導(dǎo)者因美納與“Nature Research Custom Media”共同舉辦的“2023隊(duì)列研究及精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化學(xué)術(shù)論壇暨第三屆因美納NGS大會(huì)”在南京順利召開。本次大會(huì)聚集中國、英國、美國以及新加坡等多國研究學(xué)者,超30名國內(nèi)主要隊(duì)列研究學(xué)者、院士悉數(shù)到場,共話隊(duì)列研究中國發(fā)展路徑。
自本世紀(jì)初美、英、日、法、德、中等6國科學(xué)家共同協(xié)作完成人類基因組計(jì)劃以來,以發(fā)達(dá)國家為代表的全球主要經(jīng)濟(jì)體持續(xù)加大對大規(guī)模人群隊(duì)列研究的投入和支持。與此同時(shí),過去25年間基因測序技術(shù)的高速發(fā)展以及與大數(shù)據(jù)科學(xué)的交叉應(yīng)用,使大規(guī)模生物信息數(shù)據(jù)分析研究成為可能。中國是全球最早啟動(dòng)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)和隊(duì)列研究的國家之一,“十三五”以來,中央政府以及各省市持續(xù)投入推動(dòng)中國隊(duì)列研究以及精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)發(fā)展,包括推動(dòng)了百萬量級的健康人群隊(duì)列研究以及眾多重大疾病專項(xiàng)隊(duì)列研究。本次大會(huì)聚焦全球領(lǐng)先的隊(duì)列研究以及精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化實(shí)踐經(jīng)驗(yàn),以期通過高水平國際交流協(xié)作為我國隊(duì)列研究探索出具有中國特色的發(fā)展路徑。
我國人口基數(shù)大,民族多樣性豐富,地區(qū)差異明顯,疾病譜復(fù)雜,具有開展大規(guī)模人群隊(duì)列研究的獨(dú)特優(yōu)勢。隨著中國隊(duì)列研究的發(fā)展,當(dāng)前學(xué)界對多學(xué)科多中心協(xié)作、標(biāo)準(zhǔn)體系統(tǒng)一、生物樣本數(shù)據(jù)共享等下一階段問題給予了更多關(guān)注。以中國慢性病前瞻性隊(duì)列(China Kadoorie Biobank,CKB)、泰州隊(duì)列、江蘇出生隊(duì)列等為代表的大規(guī)模人群隊(duì)列研究項(xiàng)目均取得了重要進(jìn)展,這為制定符合我國國情的疾病防控對策提供了新思路與科學(xué)依據(jù),也為全球隊(duì)列研究提供了“中國樣本”。
南京醫(yī)科大學(xué)校長胡志斌教授在開幕致辭中表示:“身處學(xué)科交叉、技術(shù)融合和平臺共享等理念實(shí)踐的前沿,以隊(duì)列研究為代表的科研項(xiàng)目將進(jìn)一步增進(jìn)國際交流與合作,不斷驅(qū)動(dòng)生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域更深層次的科學(xué)進(jìn)步。作為國家‘雙一流’建設(shè)高校,南京醫(yī)科大學(xué)始終聚焦疾病防治方案的精準(zhǔn)化研究,愿凝聚各方資源優(yōu)勢與經(jīng)驗(yàn)專長,緊密合作以發(fā)揮大規(guī)模人群隊(duì)列前瞻性研究的潛能,助力國民健康與衛(wèi)生事業(yè)高質(zhì)量發(fā)展。”
南京醫(yī)科大學(xué)校長胡志斌教授致開幕辭
英國生物樣本庫(UK Biobank,UKB)作為全球啟動(dòng)最早、規(guī)模最大、樣本最全、開放程度最高的“典型范本”,共收集了來自50萬名年齡在40到69歲之間的英國人的健康數(shù)據(jù),共有約1,500萬份生物樣本,意味著每1,000名英國人中就有7人參與其中,且平均每名參與者對應(yīng)30份樣本。英國劍橋大學(xué)Emanuele Di Angelantonio教授表示:“UKB集合了來自政府資助、科研機(jī)構(gòu)和產(chǎn)業(yè)基金等各方的力量,真正實(shí)現(xiàn)了大規(guī)模公眾支持、樣本深度分析、數(shù)據(jù)共享、成功對接醫(yī)學(xué)研發(fā)的研究目標(biāo)。UKB特有的開放性,為科學(xué)家與研究人員提供了獨(dú)特的價(jià)值——既能提供數(shù)據(jù)來指導(dǎo)實(shí)踐,又能促成新的病因?qū)W見解,使得科研‘大數(shù)據(jù)’被不斷刷新。因此,各種機(jī)構(gòu)能夠廣泛加入,形成合力,使得生物樣本庫可持續(xù)‘運(yùn)轉(zhuǎn)’,從而充分發(fā)揮它的健康影響力。”
英國劍橋大學(xué)Emanuele Di Angelantonio教授發(fā)表主題報(bào)告
中國工程院院士、中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院腫瘤醫(yī)院林東昕教授表示:“隊(duì)列研究對了解中國特有的疾病成因和防治手段的制定非常重要,以食管癌為例,全世界一半的食管癌患者在中國,我們對于食管癌的研究以及從科研成果轉(zhuǎn)化而來的食道癌早篩早診技術(shù),其實(shí)是位居世界前列的。見微知著,中國人群基礎(chǔ)健康數(shù)據(jù)庫的建立,對于改善國民健康乃至促進(jìn)世界范圍內(nèi)人群主要慢病危險(xiǎn)因素及全球病因?qū)W研究具有重要意義。”
中國工程院院士、中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院腫瘤醫(yī)院林東昕教授發(fā)表主題報(bào)告
聚智共創(chuàng),為變化中的健康命題拓徑道
目前,應(yīng)對人口老齡化已成為我們醫(yī)學(xué)健康問題的重大命題。在中國,60歲及以上人口約占總?cè)丝诘?8.9% ,到2030年這一比例預(yù)計(jì)將達(dá)25% 。基于隊(duì)列研究的成果將為應(yīng)對人口老齡化和慢性疾病帶來的健康挑戰(zhàn)提供重要價(jià)值,同時(shí)也能夠科學(xué)保障可持續(xù)的醫(yī)療保健支出。作為中國老年健康生物標(biāo)志物隊(duì)列項(xiàng)目的帶頭人,中國疾病預(yù)防控制中心副主任施小明研究員表示:“當(dāng)前,我國人口老齡化形勢突出,且老年人口多種慢性病共存比例達(dá)75%,為社會(huì)和公共服務(wù)帶來一系列挑戰(zhàn)。老齡人群健康問題的研究需要深入探究遺傳學(xué)機(jī)制,我們希望通過對全國代表性隊(duì)列和重點(diǎn)地區(qū)數(shù)據(jù)的分析研究,為我國健康老齡化的推進(jìn)應(yīng)對提供科學(xué)證據(jù)。”
中國疾病預(yù)防控制中心副主任施小明研究員發(fā)表主題報(bào)告
當(dāng)前,出生缺陷已成為我國新生兒死亡的首要因素,其發(fā)生率約為5.6% ,不僅嚴(yán)重危害新生兒健康,也給無數(shù)家庭和社會(huì)造成巨大負(fù)擔(dān)。為提升出生人口質(zhì)量并為相關(guān)策略的制定提供科學(xué)依據(jù),國內(nèi)出生隊(duì)列研究在過去十年間陸續(xù)興起。復(fù)旦大學(xué)附屬兒科醫(yī)院副院長周文浩教授表示:“在新生兒出生缺陷中,可明確遺傳診斷的約30%。危重癥患兒的遺傳病表型可能在早期還沒有出現(xiàn),或者并不典型,還有可能被其他臨床癥狀所掩蓋,這些都給遺傳病因的明確診斷帶來阻礙。在新生兒危重癥臨床隊(duì)列的實(shí)踐中,我們尤為關(guān)注整合多維度表型和基因型數(shù)據(jù),爭取在‘多組學(xué)’模式的遺傳病診斷研究方面取得突破。表型特征的精細(xì)挖掘和潛在遺傳致病位點(diǎn)的明確可以提高遺傳病診斷的概率,并最終可以推動(dòng)臨床診斷水平的提升和治療方案的完善。”
近年來,新興技術(shù)的涌現(xiàn)、突破與應(yīng)用,正不斷加速科研領(lǐng)域新發(fā)現(xiàn)的誕生與成果轉(zhuǎn)化。隨著基因測序技術(shù)的迭代升級、單位測序成本以“超摩爾定律”的速度飛速下降,科學(xué)家和研究人員能夠在有限的預(yù)算范圍內(nèi)對更多的樣本進(jìn)行測序,并結(jié)合生物信息學(xué)分析及解讀的進(jìn)步,持續(xù)驅(qū)動(dòng)著精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域新見解的快速發(fā)現(xiàn),尤其在腫瘤學(xué)、微生物等領(lǐng)域促進(jìn)了許多新的診斷和預(yù)后標(biāo)志物的研究進(jìn)展。
香港中文大學(xué)醫(yī)學(xué)院助理院長、消化疾病研究國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任于君教授表示:“以消化道腫瘤為例,隨著腸道微生物與腫瘤相關(guān)研究不斷深入,基于腸道微生態(tài)的策略在腫瘤診斷和治療中顯示出前景。目前,尋找預(yù)測性微生物的生物特征并對其進(jìn)行干預(yù)的相關(guān)研究已取得一定進(jìn)展,其間采取了包括人體微生物采樣、宏基因組測序和生物信息學(xué)分析等方式。這些科研成果有望早日轉(zhuǎn)化,應(yīng)用于臨床,從而提升消化道腫瘤及其他消化道疾病的診治水平,更快減輕患者痛苦,造福更多有需要的人。”
單個(gè)人的全基因組序列數(shù)據(jù)約為90GB(十億字節(jié)),一項(xiàng)50萬人的隊(duì)列研究僅基因組序列數(shù)據(jù)就高達(dá)約5.6 PB(千兆字節(jié)),約等于5億張照片與1.5億小時(shí)視頻的數(shù)據(jù)量。因美納人工智能副總裁、杰出科學(xué)家Kyle Farh在本次會(huì)上表示:“基于人工智能和大模型的算法正在基因數(shù)據(jù)領(lǐng)域展現(xiàn)巨大潛力,因美納研發(fā)團(tuán)隊(duì)正全力推動(dòng)基于自然選擇訓(xùn)練的AI算法在基因數(shù)據(jù)中的應(yīng)用開發(fā)。”今年6月,因美納宣布推出全新人工智能(AI)算法——PrimateAI-3D,其能夠利用靈長類動(dòng)物基因和先進(jìn)的人工智能技術(shù)來改善遺傳風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測和藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)。
因美納人工智能副總裁、杰出科學(xué)家Kyle Farh發(fā)表主題報(bào)告
因美納全球高級副總裁兼大中華區(qū)總經(jīng)理李慶現(xiàn)場致辭
因美納全球高級副總裁兼大中華區(qū)總經(jīng)理李慶表示:“我們很高興看到因美納基因測序技術(shù)的創(chuàng)新與突破能夠支持到大規(guī)模隊(duì)列研究數(shù)據(jù)分析的效率和精準(zhǔn)程度的提升。我們希望不斷拓寬科技創(chuàng)新深度與廣度,憑借技術(shù)應(yīng)用的國際經(jīng)驗(yàn)助力中國隊(duì)列研究的長足發(fā)展,形成更好的國際協(xié)同發(fā)展。很期待能夠與各方緊密協(xié)作,以今天為起點(diǎn),聚勢向未來而行,一同見證、思考、展望中國精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的高質(zhì)量發(fā)展與國民健康改善的無限可能。”(李妍)
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